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BD Rhapsody 助力單細胞測序研究

更新時(shi)間:2021-07-13

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 單細胞(bao)(bao)測序(xu)技術(shu)自2009年問世(shi),2013年被Nature Methods評為年度技術(shu)以來(lai),越來(lai)越多(duo)地被應(ying)用(yong)在(zai)科(ke)研領域。自此,單細胞(bao)(bao)測序(xu)技術(shu)被廣泛應(ying)用(yong)于(yu)基礎科(ke)研和(he)臨床研究

   單細(xi)胞在(zai)許(xu)多領(ling)域都占有(you)一席之地,對于癌(ai)癥早(zao)期(qi)的診斷、追蹤以及個體化治療具有(you)重要(yao)意義。

 

 

 

 

基本原理

 

 

   單(dan)(dan)(dan)細(xi)胞測序(xu)(xu)首先(xian)不是僅(jin)僅(jin)對一個細(xi)胞進行測序(xu)(xu),而(er)是說(shuo)該項技(ji)術能對單(dan)(dan)(dan)一細(xi)胞的基因組或(huo)轉錄組進行測序(xu)(xu),可(ke)以理(li)解為單(dan)(dan)(dan)細(xi)胞水(shui)平上的測序(xu)(xu)。

   為什么要進(jin)行單細胞測序?世界上(shang)沒有兩(liang)片相同(tong)的(de)葉(xie)子,對于多細(xi)胞(bao)生物(wu)來說(shuo)細(xi)胞(bao)與細(xi)胞(bao)之(zhi)間是存(cun)在(zai)差(cha)異(yi)的(de),很多時候是基因組(zu)、轉錄組(zu)上(shang)的(de)失之(zhi)毫厘,功能上(shang)的(de)差(cha)之(zhi)千(qian)里(li)。比如在(zai)(zai)腫瘤組織中(zhong),腫塊中(zhong)心的細胞(bao)與(yu)腫塊周(zhou)圍的細胞(bao),原發灶與(yu)轉移灶的細胞(bao),其基(ji)因組與(yu)轉錄組等(deng)遺傳信息是存在(zai)(zai)差(cha)異的,這也就導(dao)致(zhi)不(bu)同腫瘤細胞(bao)表現(xian)出免疫特性(xing)、生長速度、侵襲能力等(deng)表型(xing)方(fang)面的差(cha)異,最終導(dao)致(zhi)對不(bu)同抗腫瘤藥物的敏(min)(min)感性(xing)不(bu)同或放療敏(min)(min)感性(xing)的差(cha)異。
   傳(chuan)統測(ce)序(xu)方(fang)法所展示的(de)信息也是在多細胞(bao)(bao)水(shui)平(ping)(ping)上(shang)的(de)平(ping)(ping)均信息,而單(dan)細胞(bao)(bao)水(shui)平(ping)(ping)上(shang)的(de)測(ce)序(xu)則*可以反應(ying)同(tong)(tong)一個細胞(bao)(bao)群里(li)不(bu)同(tong)(tong)細胞(bao)(bao)的(de)基因組和轉(zhuan)錄組狀況(kuang)。單細胞測序技(ji)術的出現,使得從混雜的樣品中篩選出異質性信息的難題得以解決,該(gai)技(ji)術的成熟使用也必將生(sheng)命(ming)科學研究向前邁進一大步

 

 

 

 

BD Rhapsody

 
 

   BD Rhapsody™單細胞(bao)(bao)分(fen)析系統(tong)應運而生(sheng)(sheng)(sheng),此系統(tong)的(de)(de)誕生(sheng)(sheng)(sheng)基于 BD 在細胞(bao)(bao)生(sheng)(sheng)(sheng)物學(xue)領(ling)域 40年的(de)(de)專業(ye)技術,克服了傳統(tong)檢(jian)測(ce)的(de)(de)局限性(xing)(xing),能(neng)夠對成千上萬個單細胞(bao)(bao)的(de)(de)數百個表(biao)達基因同時進(jin)行數字定(ding)(ding)量,每個細胞(bao)(bao)提取獨立數據(ju),體現異質性(xing)(xing),可以(yi)鑒(jian)定(ding)(ding)和(he)表(biao)征新型(xing)和(he)罕見細胞(bao)(bao)類型(xing),有助(zhu)于理解從免疫學(xue)到腫瘤學(xue)等(deng)多個領(ling)域內的(de)(de)生(sheng)(sheng)(sheng)物學(xue)過程。

 

  BD重磅(bang)推出的(de)Rhapsody™單細(xi)(xi)胞(bao)分析系統克服了傳統檢(jian)(jian)(jian)測的(de)局限性,如微陣列和大量細(xi)(xi)胞(bao) RNAseq,傳統檢(jian)(jian)(jian)測依賴于對多個細(xi)(xi)胞(bao)的(de)平均檢(jian)(jian)(jian)測,來(lai)實現對細(xi)(xi)胞(bao)間微妙差異的(de)觀察。與其他(ta)單細(xi)(xi)胞(bao)分析系統相(xiang)比,BD Rhapsody™的特點及優勢在于:

 

1.更高(gao)的采樣靈敏度

靶(ba)向(xiang)分析(xi)方法有助于(yu)提(ti)高單細(xi)胞(bao)測(ce)序(xu)效率,Rhapsody系統提(ti)供(gong)的(de)檢測(ce)試(shi)劑盒(panel)可穩定的(de)重現細(xi)胞(bao)異質(zhi)性的(de)數據,可用于(yu)探索與眾多(duo)應用相(xiang)關的(de)細(xi)胞(bao)類(lei)型。且與全轉錄(lu)組(zu)擴增的(de)mRNA分析(xi)相(xiang)比,Rhapsody系統對(dui)罕見轉錄(lu)有更低(di)的(de)檢測(ce)閾值。

 

2.克服 PCR 偏差 — BD分子標簽(qian)

當(dang)對序列讀取進行計數時,PCR 擴增偏差可導致(zhi)基因定量不準確。Rhapsody采(cai)用“分(fen)子標(biao)(biao)簽”技術,能(neng)為單細胞(bao)(bao)中每(mei)個(ge)轉錄本(ben)標(biao)(biao)記特異性分(fen)子標(biao)(biao)簽,實現了(le)單細胞(bao)(bao)水平(ping)上基因表(biao)達譜的絕對定量,同時,每(mei)個(ge)細胞(bao)(bao)也會被標(biao)(biao)記特異性細胞(bao)(bao)標(biao)(biao)簽,這使高通(tong)量平(ping)行建庫(ku)成為可能(neng)。

 

3.單細胞成(cheng)像系統

對(dui)單(dan)細(xi)胞分(fen)離過程進行質控,監(jian)控細(xi)胞存活率、單(dan)細(xi)胞分(fen)離效率,有(you)效保證實(shi)驗(yan)成功率。

 

4.更高的轉錄本檢測特異性

系統通過*的數據分析流(liu)程,去除PCR錯誤擴增產物,降低細胞非特異性表(biao)達水(shui)平。

 

5.更高的(de)分辨率

可以分(fen)辨更細(xi)分(fen)、微觀的細(xi)胞群和細(xi)胞亞種(zhong)群。

 

6.更經濟的測(ce)序和(he)設備預算

結合Rhapsody*的單細(xi)胞分離(li)技術,單次實驗(yan)可制(zhi)備100-10000個(ge)單細(xi)胞文庫,用戶可根據需求定(ding)制(zhi)引物,將檢測范圍集中在目標(biao)基(ji)因,大(da)幅降(jiang)低后續測序成本。

 

 

   隨著人們(men)逐漸意識到(dao)單(dan)(dan)細胞(bao)研(yan)究對認(ren)識人自身(shen)以及疾病的(de)重(zhong)要性,單(dan)(dan)細胞(bao)測序(xu)技(ji)術的(de)誕生恰(qia)逢其(qi)時(shi)。目前單(dan)(dan)細胞(bao)測序(xu)已經廣(guang)泛(fan)用于微(wei)生物學、神(shen)經學、人體發育、免疫、癌(ai)癥、輔(fu)助(zhu)生殖等(deng)領域的(de)研(yan)究。相(xiang)信此次(ci)BD Rhapsody單(dan)(dan)細胞(bao)分析(xi)系統的(de)閃亮登(deng)場,能(neng)夠(gou)為目前高速發展中的(de)精準醫(yi)學帶來濃墨重(zhong)彩的(de)一筆。