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深入理解RNA轉錄組學:從樣本采集開始

更新時(shi)間:2023-11-01

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今天(tian)我們將(jiang)探討一個與(yu)生物學和基因(yin)研究密切相(xiang)關(guan)的(de)(de)領域——RNA轉錄組學。在這個學科中,研究者們主(zhu)要關(guan)注細胞內所有基因(yin)活性表達的(de)(de)信息,即RNA分(fen)子。而這些信息的(de)(de)獲取則始于(yu)一項至關(guan)重要的(de)(de)工作——樣本(ben)采(cai)集(ji)。

那(nei)么(me),究竟(jing)什么(me)是RNA轉錄組學呢?簡單(dan)來說,它是一種利用高通量測(ce)序技術分(fen)析細胞、組織或器官(guan)中的(de)RNA分(fen)子(zi)的(de)技術。這些RNA分(fen)子(zi)包(bao)括(kuo)mRNA(編(bian)碼蛋白質的(de)RNA)、lncRNA(長鏈非編(bian)碼RNA)等不同(tong)類(lei)型,它們代表了基因(yin)在特定時(shi)間(jian)(jian)和空間(jian)(jian)內(nei)的(de)活性狀態。

RNA轉錄組(zu)學(xue)的(de)重要(yao)性(xing)在于它(ta)能夠幫助(zhu)我們了解(jie)基因(yin)如何控制生(sheng)命過程,如生(sheng)長發育、生(sheng)理代謝以及疾病的(de)發生(sheng)發展等。同(tong)時,通過對不(bu)同(tong)組(zu)織(zhi)、不(bu)同(tong)個體或(huo)不(bu)同(tong)病程的(de)RNA進行比較分析,還能發現關鍵性(xing)的(de)差(cha)異表達基因(yin),從而揭(jie)示潛在的(de)藥物靶點或(huo)診斷標(biao)志(zhi)物。

然而,在開始RNA轉錄組學研(yan)究之前,必須(xu)首(shou)先(xian)解(jie)決的(de)問題是(shi)如何正確地采集和保存樣本。這是(shi)因為細胞內的(de)RNA十(shi)分不(bu)穩定,容(rong)易降解(jie)或發生(sheng)變異,從而影響后續的(de)研(yan)究結(jie)果。以下是(shi)一些關于RNA轉錄組學樣品采集的(de)基(ji)本原則:

  1. 樣品類(lei)(lei)型:選擇(ze)(ze)具有代表(biao)性且便于獲取(qu)的(de)(de)樣品類(lei)(lei)型,如血液、組織切(qie)片、細胞(bao)培養物等。需要注意(yi)的(de)(de)是,不(bu)同的(de)(de)組織類(lei)(lei)型的(de)(de)RNA豐度(du)可能(neng)有所不(bu)同,應根據研究(jiu)目的(de)(de)合理選擇(ze)(ze)。

  2. 樣(yang)品數量:通(tong)常要求(qiu)至少50-100mg新鮮組織,或者至少1x106個細(xi)胞。此外,還(huan)需考慮(lv)重(zhong)復(fu)實驗的需求(qiu),確保(bao)有足夠的樣(yang)品供使用。

  3. 采樣時間(jian):盡量在生物(wu)鐘節律的同一階段(duan)進(jin)行取樣,因為(wei)某些基因的表達水平可(ke)能(neng)會受到時間(jian)的影響。

  4. 采樣方法:使用無菌操作,避免引(yin)入(ru)外界(jie)污染。快(kuai)速冷凍(dong)樣品以防(fang)止(zhi)RNase酶的活(huo)性,并(bing)盡快(kuai)轉移(yi)到液氮(dan)中長期保存。

  5. 保存條(tiao)(tiao)件(jian):最佳的(de)保存條(tiao)(tiao)件(jian)是將(jiang)樣品迅速冷(leng)凍至-80℃,然后轉移至液氮罐中長期(qi)儲存。如(ru)果條(tiao)(tiao)件(jian)有限(xian),則可以先冷(leng)凍至-20℃,但需盡快(kuai)處理(li)并轉存至更低溫環境中。


產品名稱(cheng):PAXgene全血RNA管 樣本采集(ji)保存(cun)
產(chan)品貨號(hao):762165
產品(pin)規格:2.5mL,100支/盒(he)

產品介紹:
PAXgene血液RNA管旨在立即穩定細胞內RNA,從而產生準確且可重復的(de)基因(yin)表(biao)達數據。PAXgene血液RNA管含有一種專有試(shi)劑(ji),可在采集(ji)后(hou)立即穩定細胞內RNA。細胞內RNA在室溫下(xia)穩定長達三天(tian)(tian)或(huo)在2-8°C下(xia)穩定長達五天(tian)(tian)。PAXgene試(shi)管可以(yi)在-20°C至-70°C的(de)溫度下(xia)冷凍,以(yi)便(bian)長期儲存(cun)。

只有(you)高質量的樣品(pin)才能提(ti)供準(zhun)確可靠的數據,進一步推(tui)動(dong)我們對(dui)生命現象的理解和(he)探索。希(xi)望(wang)這篇文(wen)章能為您的學習和(he)科研帶來一些(xie)啟示和(he)幫助(zhu)!